東京奪還編、開戦。　　謎の少年?スティグマ率いる“アマラリルク”との戦いを経て少し成長したシャイ。　　日本に戻ってきた彼女が出會ったのは、忍者の里から家出中という少女?天王寺曖だった?！　”伺稀哎ⅴ蕙楗辚毳堡我粏Tを追って里を出てきたとシャイに告げる。　　そんな中、東京が突如黒球に包まれて消失する事件が発生。ヒーローたちは東京を救出するため出動するーー。